No tengo una respuesta definitiva para tu pregunta.
Tengo entendido que al momento de chipear tu consola es imperativo no volverlo a conectar al internet, ya que de hacerlo, se perderá la integridad del trabajo que se realizo en tu consola y la compañía sabrá que haz hecho con tu consola y te la bloquea.
No impide volver a realizar el trabajo pero ya es mas tedioso que la primera vez que se hace.
Esta es una página de referencia que encontré con algunas dudas y sus respuestas referentes a tu pregunta. Ojalá y te funcione:
http://wiibrew.org/wiki/Homebrew_Channel/Help#What_is_the_Homebrew_Channel_all_about.3F