Puede haber varios motivos, el circuito de luces direccionales y luces de emergencia son independientes a pesar que comparten el flasher o destellador combinado.
Lo que te recomiendo es empezar por checar los fusibles.
En esta pagina puedes ver un tutorial y un video que te orientaran para probar los fusibles
http://www.mecanicalibre.com/fusibles_automotrices.html