Hola colega, manuel, NO, en los circuitos que regulan a travez de PWM ( modulación por ancho de pulso), como su nombre lo indica, se hace variando el ancho del pulso, no la frecuencia del mismo, te coloco un ejemplo:

si observa la figura 1 y 3, ambas tienen la misma frecuencia (40KHz aprox), el ciclo se repite cada 25 uSeg. éso significa que la frecuencia es igual, pero el ancho de los pulsos son muy diferentes y dependiendo exactamente de ése ancho de pulso, los transistores FET estarán mas o menos tiempo conduciendo y de éso dependerá igualmente el voltaje que se generará en el secundario, pues entre más tiempo o más ancho sea el pulso, más tiempo estarán cargando los filtros y por ende el voltaje se sostendrá mucho más. así que a mas ancho el pulso, mas voltaje, cabe recordar que los tiempos con los cuales trabajan éstas fuentes son de microsegundos por tanto las frecuencias son muy altas, del orden de 100KHz a 400 KHz dependiendo del circuito, así entonces variando el tiempo útil del ciclo, o sea el ancho del mismo, se logrará mantener mejor el voltaje requerido.