Hola,
En principio sí. Igualmente toma la tensión con el de 12V conectado no sea que sea algo superior a los 14V. También puedes poner un par de diodos en serie (del tipo 1N4001 o similares) para reducir 1,2V aproximadamente. Pero también lo importante es que el fan de 12 V sea de similar consumo que el original, sobre todo si el fan está controlado.
Saludos