La flama de mi boiler se escapa por la tapa y me empezó a quemar el termostato
Por lo que no puede estar encendido
Ya hice el remplazo de el regulador de gas y no cambio 
Tambien ya se remplazo el quemador 

Tiene que regular el aire, intente dar menos aire.

Puede ser que esté dañado el deflector de gases interno o el conducto de evacuacion de gases y no se genere el "efecto chimenea" que ayuda succionando los gases calientes. Debes hacer revisar la instalación por un profesional competente ya que puede generar monóxido de carbono que es mortal. 
Saludos