Pueden ser muchas las causar.
Abre administrador de dispositivos, ordena por CPU y por Memoria, en ambos casos de mayor a menor. Verifica qué procesos consumen más recursos.
Puede que las actualizaciones automáticas ralenticen el sistema hasta que se ponga al día. He pasado hasta un día completo para que un sistema recién instalado se actualice al día.
Pueden ser drivers desactualizados. O dejas que las actualizaciones automáticas lo hagan o lo anticipas con Driver Booster de IOBIT. Instalas, ejecutas, actualizas todos los drivers y luego reinicias.
No indicas qué sistema operativo instalaste, pero puede que si es de 32 bits instalado sobre un sistema de 64bits no sea lo más optimo.
Realiza lo que he comentado. Si validaste que el disco funciona bien, solo queda hacer lo que comento y evaluar resultados.