Yo te sugiero dos cosas....
una es la más compleja que es usando el tmpeg...hay una guia de eso en esta dirección:
http://www.videoguias.com.ar/dividir.html
Pero el crédito de eso no me corresponde a mí sino a la gente de esa web.
Y si no lo mas facil, conseguite un editor de video (por ejemplo el ulead videostudio, o el pinnacle, me parece que con el movie maker no se puede pero nunca probé) y armá dos avis y fue...
Aunque si querés un resultado más profesional: solución 1.
Saludos. :D