MI consejo es muy práctico.
1. Ejecuta CMD
2. Escribe CD (y el nombre de la uniad p. ej g:)
2. Una evz estés dentro del pendrive usa el comando attrib
Sigue los pasos que se indican en el enlace que te paso. https://intelaf.wordpress.com/2013/04/08/como-eliminar-virus-que-convierten-las-carpetas-en-accesos-directos/
no, no me funciono no están ocultos al parecer no están dice carpeta vacía y no hay enlaces
checa este otro en lo personal ami me a funcionado en momentos críticos jejejeje
https://www.youtube.com/watch?v=N7brvhx5heo
lo siente queria darle la solucion aceptada a ti y no se cambiarla pues tu intestaste lo que mas pudiste
bueno nunca encontre la solucion pero ya he aprendido a tener todo en una particion del disco y no confiar mucho en un pendrai claro no niego que son utiles, pero no quisiera nuevamente arriesgarme