Lo que te esta pasando es que estas teniendo conflictos de versiones, es decir tienes la version profesional y le estas poniendo la Home, la forma mas rapida de hacerlo es eliminando todas las particiones del disco previo backup de al informacion, para hacerte la tarea mas facil baja el software de setup del fabricante del mimo, eliminas todos y particionasy formateas desde ahi mismo, tanto W.D., Seagate, MAxtor y Samsung tienen uno y esta en la seccion de downloads de su pagina, son boteables por lo que no tendras ningun problemas, o en su defecto descargate el " the Ultimate Boot CD" (
http://www.ultimatebootcd.com/) que ya tienen integrada muchas de estas herramientas.
Saludos y suerte.