Si tenés virus en alguna carpeta que hacés el backup entonces se te guarda el virus. Consejo: poné tu disco en otra pc que tenga un antivirus actualizado y escanealo.
Para formatear lo que tenés que hacer es reiniciar en modo dos si tenés el win98 y ponés en el prompt format c: y se formatea el rígido si es que tenés una sola partición y si tenés ma´s de una entonces se formatea solamente la partición c.
Consejo: utilizá el fdisk y particioná en dos el rígido para que en el c le dejes solamente el SO y en el d pongas todos tus archivos así la próxima vez no vas a tener que estar haciendo todo el despiole del backup.
También podés crearte un disquete de inicio y bootear desde la disquetera para que inicie desde allí y ponés format c: y realiza lo mismo.
Con el tema de los drivers, antes tendrías que conseguirlos o sino hay programas que te permiten realizar backups de ellos para después volver a instalarlos. Si querés averiguar qué necesitás podés bajarte el Everest Home de
acá y con este programa instalado te va a decir los componentes de tu pc.