Pude solucionar el problema en la que tenía. El problema es que la placa usa el riel de 12v solo para hacer funcionar el IC que carga la batería, despues todo lo demas funciona con el riel de la batería (voltaje de la batería si esta presente, sino unos 8.6v que da el integrado BQ715). Probando los mosfets en la placa, encontré que los 12v llegaban bien a uno de los mosfets pero el complementario que va conectado a tierra estaba en corto (son dos mosfets que están muy cerca del BQ715, el que tenía quemado era el de la derecha). Cambiando ese se solucionó el problema de carga de la batería y la pc prende perfectamente