tendrias que indicar el modelo, los discos son ide o sata? y reservado para sistema es algo que utiliza para los windows no te preocupes por eso, el otro disco que cambio de unidad se ve la informacion?
tendrias que ir al setup, ir a la parte de discos y en algun lado tiene que decir hard disk priority o algo asi y elegis que disco es el que reconocera primero, esto si son sata.. de ahi vas a poder elegir..
sino podes fijarte en algunos mother presionando f8 o f9 te da a elegir de donde bootear y ahi elegir el disco donde tens windows 7 pero eso tenes que cambiarlo desde el setup y orden de arranque y prioridad de disco