Sugiero, para "aclarar", incluyas fotografía de BIOS, captura de "sin disco", y captura de "con disco". Te animas?
El disco que tiene el windows es IDE, de los viejitos. y los otros 2 son SATA, mas el nuevo. En la BIOS los reconoce todos, pero como digo, estaba funcionando bien todo antes de conectar el disco nuevo, ahora no me aparecen las demas unidades. Mira ahora edito el post con imagenes nuevas
Por lo que veo en las imágenes. Ahí hay un solo disco. Con dos unidades lógicas, C: y D:. Ninguna refleja a tu disco de 1TB. Ni a ún tercer disco que ahora me nombras.
Sin toda la info posible, se dificulta más. Veremos de intentar aportar igual. Si se me ocurre algo comento.
En la foto esta configurado como esclavo. Se ha de corresponder con dicha posición en el cable IDE
En captura de la BIOS se ve disco de 1TB conectado en Canal IDE 1 como Master. Tiene mal el jumper. Debes conseguir uno y configurarlo como master, o puedes conectarlo como esclavo en otro de los canales IDE.