como primer aspecto amigo hayq ue asegurarse de que nuestro S.O (sistema operativo) es compatible con el sistema de archivos (fat 16, fat 32, ntfs) que tenemos en la partición en que vamos a isntalarlo y además , si podrá leer las otras particiones de nuestro disco duro segun el sistema de archivos que tengamos en ellas. para que te des una idea es maso menos así... fat 16 no ve particiones en (fat 32 y ntfs), fat 32 no ve particiones en ntfs. en caso contrario ntfs ve particiones tanto en (fat 16 como en fat 32), en el caso de fat 32 ve particiones en (fat 16 y fat 32) y por ultimo fat 16, no mira ningun otro tipo de sistema de archivos ni( fat 32 ni ntfs, solo fat 16). en fuin un ejemplo es el siguiente si yo instalo xp en tudisco c (fat32) no voy a poder ver partivciones en (ntfs) osea no se si me explico, en mi humildeopinión te recomiendo que uses ntf para todas... espero haberte ayudado y haya sido claro