debes tener instalado el programa USB Safely Remove que evita la conexion y desconexion violenta. En el siguiente enlace esta un programa que repara pendrive:
http://www.apacer.com/en/support/downloads/Repair_v2.9.1.1.zip
Espero te sirva. Te mando un saludo.
PD: si lo vas a formatear que sea a baja velocidad.